中国mNGS行业:广覆盖、高敏感性成为病原微生物检测新风口

来源: 头豹研究院 2023-08-08 10:15:43


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感染性疾病是当今严重威胁人类健康的重大疾病之一,因此快速准确的诊断是有效治疗、病情监测和控制疾病蔓延的重要前提,在此背景下,弗若斯特沙利文(Frost & Sullivan,简称“沙利文”)分析了中国mNGS行业的技术优势及行业发展最新动态,特此发布《2023年中国mNGS技术动态短报告》。本报告将概括mNGS基本原理及技术优势、通过其在临床应用以及感染性疾病领域中的实际应用梳理,看其在中国市场的发展空间。

在临床医学诊断和治疗的工作中,病原微生物检测具有举足轻重的作用,传统的检测手段主要有涂片镜检、分离培养和免疫血清学检查,近年随着核酸扩增、核酸测序等技术的发展,使得分子生物学技术在病原诊断率、阳性检出率进一步提高,可为病原微生物检测、致病性与耐药性分析、流行病学调查和医院感染防控等方面做出更多贡献。

传统病原微生物检测方法的操作相对简单、可覆盖的病原微生物种类有限、检测周期长且操作步骤繁琐、高度依赖人工经验与操作因此整体检测效率较低,且细菌耐药性的不断增强也为微生物诊断带来一定困难。随着我国对传染病防治体制与基础能力建设的不断投入,微生物检测技术正在快速发展,自上世纪80年代以后,微生物检测行业进入了快速微生物检测阶段并成为了行业重点发展方向。

根据南京医科大学附属无锡第二人民医院赵虹卿教授团队对140例疑似肺部感染住院患者进行mNGS检测及常规检测的实验数据显示,mNGS在总阳性率检出效果高于常规实验室诊断方法,其敏感性(89.17%)明显高于常规检测(50.00%)。因此,mNGS技术凭借可直接对样本无差别、无选择性的进行高通量测序,无需对病原体进行分离培养以及扩增,所形成的广覆盖、非靶向、高通量以及高敏感性的特性,缩短了检测时间并提高了检测效率,近年成为病原微生物检测的新风口。

mNGS指的是宏基因组二代测序技术,不依赖于传统微生物培养,可直接提取标本中的全部核酸进行高通量测序,通过对生物信息的分析,在去除人源序列后,可将筛选出的数据与病原数据库进行比对,获得疑似致病微生物的种属信息。mNGS的检测流程涵盖了标本采集、核酸提取、文库构建、上机测序、生物信息分析以及报告解读阶段;其中标本质量、微生物的相对丰度及绝对丰度、数据库的完整性及无偏差性会对mNGS检测结果产生重要影响,因此核酸提取、文库构建及生物信息分析是全流程中至关重要的质量控制环节。

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